Aerococcus urinae (A. urinae) definierades tidigare som en enskild art inom Aerococcus-släktet, men har nyligen visat sig utgöra ett komplex beståendes av 6 olika kluster, varav 2 ej ännu är artbestämda. Bakterier i A. urinae-komplexet är humanpatogena och kan orsaka bland annat sepsis. MALDI-TOF MS är den mest framstående metoden för artbestämning av bakterier och lämpar sig särskilt för identifiering av Aerokocker. I dagsläget finns inget referensbibliotek för identifiering av arterna inom A. urinae-komplexet. Därmed har syftet med denna studie varit att skapa detta bibliotek med WGS som grund för säker artbestämning. DNA-extraktion inför WGS och MALDI-TOF MS har utförts på A. urinae komplex-stammar isolerade från urin-och blododlingar vid Klinisk mikrobiologi i Lund. MSP har skapats utifrån MALDI-spektran erhållna från studenter tidigare involverade i samma projekt. Efter kontinuerlig bearbetning av metoden för DNA-extraktion har DNA som uppfyller kvalitetskriterierna för WGS extraherats från 7 stammar. Tillräckliga MALDI-spektran för att skapa MSP har genererats från 7 stammar och MSP har skapats från 18 stammar. Skapade MSP:n visar en förmodad svårighet att urskilja arterna inom A. urinae-komplexet med hjälp av MALDI-TOF MS. Metoden för att generera MSP kan behöva utvecklas genom att bland annat höja gränsvärdet för godkänt MALDI-score eller identifiera arterna utifrån specifika markörer. Ett framgångsrikt MALDI-bibliotek för att urskilja arterna inom A. urinae-komplexet kommer bli nödvändigt för att i framtiden kunna styra behandlingen av bland annat sepsis orsakad av specifika A. urinae-komplexa arter. 

Aerococcus urinae, earlier defined as a lone species within the Aerococcus genus, has recently been shown to constitute a complex consisting of 6 clusters, 2 of which have yet to be determined as species. Bacteria in this complex are human pathogens and can cause sepsis among other diseases. MALDI-TOF MS is the most prominent method for bacteria species determination and is especially suitable for identification of Aerococci. There is no current reference library for identification of species within the A. urinae complex. Therefore, the aim of this study was to create this library with WGS as the basis for secure species determination. DNA extraction for WGS and MALDI-TOF MS have been performed on A. urinae complex strains isolated from urine- and blood cultures at the Clinical Microbiology laboratory in Lund. MSP have been created from earlier acquired MALDI spectra. After continuous adaptation of the extraction method, DNA fulfilling quality criteria for WGS has been extracted from 7 strains. Sufficient MALDI spectra to create MSP have been generated from 7 strains. MSP have been created from 18 strains. Created MSP show probable difficulty to distinguish species within the A. urinae complex using MALDI-TOF MS. The method for generating MSP may have to be elaborated by raising the approved MALDI score threshold or using specific markers for species identification. A successful MALDI library to distinguish species within the A. urinae complex will be necessary during decision of treatment for sepsis among other diseases caused by specific species within the A. urinae complex.