Aerococcus urinae (A. urinae) identifierades år 1992 i samband med urinvägsinfektioner och anses vara patogen hos människor. För att särskilja Aerococcus arter används sekvensering av 16S rRNA-genen, men MALDI-TOF MS är idag en mer kraftfull och snabbare metod för noggrann identifiering. En studie publicerad 2023, baserad på helgenomsekvensering (WGS) visade att A. urinae-komplexet, tidigare benämnts A. urinae, består av sex taxonomiska grupper, A. urinae, A. mictus, A. tenax och A. loyolae, samt två grupper som inte har fått specifika artnamn, Aerococcus sp. grupp 1 och Aerococcus sp. grupp 2. För närvarande saknas ett referensbibliotek för artidentifiering inom Aerococcus urinae-komplexet och syftet med denna studie var att skapa och utvärdera ett nytt MALDI-bibliotek för förbättrad artbestämning av A. urinae-komplexet. Studien omfattade odling av 34 stammar tillhörande A. urinae-komplexet, följt av MALDI-TOF MS-analys samt extraktion av DNA inför WGS, varvid DNA-kvalitet och koncentration verifierades. Tidigare genererade MALDI-spektra från samma forskningsprojekt användes för att skapa Main Spectra Profiles (MSP), vilka därefter låg till grund för uppbyggnaden av ett preliminärt MALDI-TOF MS-bibliotek. Resultaten från studien visade att det nya MALDI-biblioteket ännu inte har kunnat utvärderas med full tillförlitlighet på grund av avsaknaden av tillräckligt många artbestämda referensstammar. Trots dessa begränsningar utgör studien en viktig grund för vidare utvärdering av MALDI-TOF MS som metod för identifiering av Aerococcus arter, då det ger värdefulla insikter som kan leda till förbättrade referensbibliotek och mer tillförlitliga metoder för artidentifiering i framtiden.

Aerococcus urinae (A. urinae) was identified in 1992 in association with urinary tract infections and has since been recognized as a human pathogen. While 16S rRNA gene sequencing has traditionally been used to differentiate Aerococcus species, MALDI-TOF MS is currently regarded as a more rapid and powerful method for accurate identification. A study published in 2023, based on whole genome sequencing (WGS), demonstrated that the A. urinae-complex, previously considered solely as A. urinae, comprises six taxonomic groups, A. urinae, A. mictus, A. tenax, and A. loyolae, as well as two groups lacking formal names, designated as Aerococcus sp. group 1 and Aerococcus sp. group 2.

At present, there is no reference library available for species identification within the Aerococcus urinae-complex. The aim of this study was therefore to develop and evaluate a novel MALDI-TOF MS library to improve species-level discrimination within the A. urinae-complex. The study involved the cultivation of 34 strains belonging to the A. urinae complex, followed by MALDI-TOF MS analysis and DNA extraction for WGS, during which DNA quality and concentration were verified. Previously generated MALDI spectra from the same research project were utilized to create Main Spectra Profiles (MSPs), which subsequently formed the basis for constructing a preliminary MALDI-TOF MS library. The results indicated that the newly developed MALDI library could not yet be reliably validated due to an insufficient number of species-confirmed reference strains. Despite these limitations, the study provides an important foundation for further evaluation of MALDI-TOF MS as a tool for identification of Aerococcus species, offering valuable insights that may facilitate the development of enhanced reference libraries and more reliable species identification methods in the future.