Aerococcus spp. är grampositiva bakterier som anses vara patogener hos människor och har länge varit svåra att identifiera på grund av likheten med andra bakterier. Tidigare forskning förlitade sig på 16S rRNA-sekvensering för artbestämning, men införandet av MALDI-TOF MS revolutionerade artidentifieringen. Med hjälp av MALDI-TOF MS, kombinerad med omfattande helgenomanalyser, har Choi et. al år 2023 visat att Aerococcus urinae kan delas in i flera taxonomiska grupper: Aerococcus tenax, Aerococcus mictus, Aerococcus loyalae samt Aerococcus urinae. Huvudsyfte med denna studie var att utvärdera det nya MALDI-biblioteket för dessa arter men även kartlägga deras förekomst i urin och blod i Skåne. Det möjliggjordes med 223 Aerococcus-positiva stammar från urinodlingar och 130 från blododlingar, varav totalt 276 tidigare kallad A. urinae analyserades. Metoden var uppdelad i tre huvudsakliga block: etablering av PCR som referensmetod, en förstudie där både MALDI-TOF MS och PCR kördes parallellt, och slutligen en PCR-screening för att försöka maximera upptäckten av nya Aerococcus-arter. Resultaten har visat att endast några av dessa arter identifieras med PCR, 37 av 276 stammar, och med en hög överenstämmelse med MALDI-resultat (A. mictus n=15, A. loyalae n=20, A. urinae n=2). Studien har också indikerat en potentiell skillnad i förekomsten av Aerococcus-arter mellan blod- och urin, där A. mictus dominerar i båda, följt av A. sangunicola, och A. loyalae. Sammanfattningsvis kan inte det nya MALDI-biblioteket tillförlitligt utvärderas på grund av brist på välkaraktäriserade stammar för nya arter och begränsningar av referensmetoden. Trots detta ger studien ett underlag för att bättre utvärdera MALDI-TOF MS för Aerococcus-identifikation.

Aerococcus spp. are Gram-positive bacteria considered as human pathogens, historically challenging to identify due to their similarity with other bacteria. Previous research relied on 16S rRNA sequencing for species identification, until the revolutionary introduction of MALDI-TOF MS. Choi et al. utilized this method in 2023, combined with comprehensive whole genome analyses, and demonstrated that Aerococcus urinae can be classified into four taxonomic groups: Aerococcus tenax, Aerococcus mictus, Aerococcus loyalae, and Aerococcus urinae. The aim of this study was to evaluate the new MALDI-library for these species and map their occurrence in urine and blood in Skåne. This was made possible by 223 Aerococcus-positive strains from urine cultures and 130 from blood cultures, with a total of 276 previously called A. urinae strains analysed. The methodology comprised three main phases: establishing PCR as the reference method, conducting a pilot study running MALDI-TOF MS and PCR simultaneously, and performing a PCR screening to enhance the detection of new Aerococcus species. The results revealed that out of 276 strains, only 37 was successfully identified with PCR, with results matching that of MALDI-TOF MS (A. mictus n=15, A. loyalae n=20, A. urinae n=2). The study also indicated a potential difference in the occurrence of Aerococcus species between blood and urine, where A. mictus dominated both, followed by A. sangunicola and A. loyalae. In conclusion, the new MALDI-library cannot be reliably evaluated due to a lack of well-characterized strains and limitations of the reference method. Nevertheless, the study provides a basis for better evaluation of MALDI-TOF MS for Aerococcus identification.