Malmö University Publications
Change search
CiteExportLink to record
Permanent link

Direct link
Cite
Citation style
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Other style
More styles
Language
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Other locale
More languages
Output format
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Validering av ett nytt MALDI-biblotek och identifiering av nya potentiella biomarkörer för arter och underarter till Streptococcus bovis/ Streptococcus equinus-komplexet med MALDI-TOF MS.
Malmö University, Faculty of Health and Society (HS).
2024 (Swedish)Independent thesis Basic level (degree of Bachelor), 10 credits / 15 HE creditsStudent thesis
Abstract [sv]

Streptococcus bovis/Streptococcus equinus-komplexet (SBSEC) är en grupp avgrampositiva bakterier som hör till gruppen D-streptokocker och som normaltfinns i mag- och tarmkanalen hos både människor och djur. Dessa bakterier är oftaassocierade med bakteriemi, endokardit och kolorektalcancer. Matrix-assistedlaser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry (MALDI-TOF MS)har revolutionerat mikrobiologisk diagnostik genom snabb och exakt identifieringav mikroorganismer, men begränsas av dess förmåga att skilja nära besläktadearter och underarter. Det finns ett behov av korrekt identifiering av underarterinom SBSEC eftersom detta har kliniska implikationer. Därför finns det behov attvalidera det nya MALDI-biblioteket men även att undersöka om det finns unikabiomarkörer för arter och underarter inom SBSEC. Totalt 184 isolat av SBSEC,identifierade till art- och underartsnivå genom helgenomsekvensering, odlades påblodagar under aeroba förhållanden och FAA-agar under anaeroba förhållanden. För preparering inför analys användes tre metoder: direktöverföring, utökaddirektöverföring, samt extraktion i rör. Genom att analysera masspektra insamladefrån en initial testgrupp (n=111), undersöktes möjligheten att identifiera unikabiomarkörer för varje art och underart. Studien visade imponerande noggrannhet iatt exakt identifiera både arter och underarter, där 98% av de testade stammarnakorrekt klassificerades till rätt art och underart med alla tre använda preparationsmetoderna, samt lyckades identifiera unika biomarkörer för SBSEC. Slutsatsen är att det ny utvecklade MALDI-biblioteket har en hög precision ocheffektivitet i art- och underartsidentifieringen av SBSEC-isolat. Identifieringen avunika biomarkörer för specifika arter och underarter inom SBSEC var möjlig menbehöver valideras för att säkerställa tillräckligt unika och stabila biomarkörer somkonsekvent kan skilja mellan olika arter och underarter.

Place, publisher, year, edition, pages
2024. , p. 28
Keywords [sv]
Streptococcus bovis/Streptococcus equinus-komplexet (SBSEC), MALDI-TOF MS, Helgenomsekvensering, Bakteriella biomarkörer, Arts- och underartsidentifiering.
National Category
Microbiology
Identifiers
URN: urn:nbn:se:mau:diva-68760OAI: oai:DiVA.org:mau-68760DiVA, id: diva2:1869720
Educational program
HS Biomedicinsk laboratorievetenskap
Supervisors
Examiners
Available from: 2024-06-14 Created: 2024-06-13 Last updated: 2024-06-14Bibliographically approved

Open Access in DiVA

No full text in DiVA

Search in DiVA

By author/editor
Mulaku, Vlora
By organisation
Faculty of Health and Society (HS)
Microbiology

Search outside of DiVA

GoogleGoogle Scholar

urn-nbn

Altmetric score

urn-nbn
Total: 54 hits
CiteExportLink to record
Permanent link

Direct link
Cite
Citation style
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Other style
More styles
Language
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Other locale
More languages
Output format
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf