Staphylococcus aureus är en primärpatogen bakterie som kan orsaka infektioner hos friska individer. Bakterien har under långa tider utvecklat resistent mot de vanligaste antibiotikabehandlingar som används inom vården vilket har försvårat behandlingarna mot bakterien. Nya antibiotikabehandlingar undersöks frekvent för behandling mot infektioner orsakad av bakterien. Vid introduktion av penicillin för behandlingar mot bakterien har det noterats att stammar av bakterien är resistenta mot penicillin. Orsaken till detta tros bero på stammar av bakterien uttrycker blaZ, en gen som leder till produktion av enzymet betalaktamas som spjälkar den funktionella delen av antibiotikan vid behandling av bakterien. Genom ökad kunskap om blaZ görs frekventa studier för identifiering av blaZ. Samtidigt som identifiering av blaZidentifieras även nuc som är en kontroll för att bakterien som analyseras är en stafylokock. Identifiering av blaZ är kvalitativ där påvisning av genen i ett prov är av intresse. Tidigare studier för identifiering av blaZ utgörs mest av PCR-analyser med konventionell PCR och ytterst få görs realtids-PCR. Trots att den konventionella PCR-analysen är både mer tidskrävande och är en tvåstegsmetod fortsätts den göras istället för realtids-PCR som både är snabbare och är en enstegsmetod. Med denna anledning görs nu en studie för att framställa ett optimalt realtids-PCR protokoll samt en fungerande primer/prob-mix för identifiering av blaZ. Testning av primers, prober och annealing temperatur görs. Framställning av ett realtids-PCR protokoll och en fungerande primer/prob-mix anses har lyckats då identifiering av blaZsamt nuc kan detekteras med hjälp av primer/prob-mixen. Tidigare sparade stammar testades med det framställda realtids-PCR protokollet och primer/prob-mix vilket resulterade till identifiering av blaZ och nuc på de stammar som förväntades uttrycka blaZ och endast nuc för de stammar som förväntades att inte uttrycka blaZ.

Staphylococcus aureus is a primary pathogenic bacterium that can cause infections in healthy individuals. Bacteria have for a long-time developed resistance to the most common antibiotic treatments used in healthcare, which has made the treatments against the bacterium more difficult. New antibiotic treatments are frequently examined for treatment of infections caused by the bacterium. When introducing penicillin for treatments against the bacterium, it has been noted that strains of the bacterium are resistant to penicillin. The reason for this is believed to be due to strains of the bacterium expressing blaZ, a gene that leads to the production of the enzyme beta-lactamase which breaks down the functional part of antibiotics in the treatment of the bacterium. Through increased knowledge of the blaZ, frequent studies are performed to identify blaZ. At the same time as identifying blaZ, the nuc is also identified, which is a control that the bacteria being analyzed is a staphylococcus. Identification of the blaZ is qualitative where detection of the gene in a sample is of interest. Previous studies for the identification of blaZ consist mostly of PCR analyzes with conventional PCR and very few real-time PCRs are performed. Although the conventional PCR analysis is both more time consuming and is a two-step method, it continues to be done instead of real-time PCR which is both faster and is a one-step method. For this reason, a study is now being carried out to produce an optimal real-time PCR protocol as well as a working primer/probe-mixture for identifying blaZ. Testing of primers, probes and annealing temperature is done. Production of a real-time PCRprotocol and a functioning primer/probe-mixture is ​​considered to have been successful as identification of blaZ and nuccan be detected using the primer/probe-mixture. Previously saved strains were tested with the prepared real-time PCRprotocol and primer/probe-mixture which resulted in the identification of blaZ and nuc on the strains that were expected to express the blaZ and only nuc for the strains that were expected not to express the blaZ.