Publikationer från Malmö universitet
Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Jämförande studie av PCR-metoder för identifiering av icke-tuberkulösa mykobakterier
Malmö universitet, Fakulteten för hälsa och samhälle (HS).
2020 (Svenska)Självständigt arbete på grundnivå (kandidatexamen), 10 poäng / 15 hpStudentuppsats (Examensarbete)
Abstract [sv]

Den mest välkända arten i släktet Mycobacterium som kan orsaka sjukdom hos människan är Mycobacterium tuberculosis (MTB). Infektioner av andra mykobakterier ökar världen över. Dessa benämns icke-tuberkulösa mykobakterier (NTM) och orsakar ofta liknande symtom som de vid MTB-infektion. Vanligtvis krävs dock olika behandlingar beroende på om infektionen är orsakad av MTB eller av NTM. Nuvarande diagnostik bygger på odling och mikroskopi, men analyser som innefattar molekylärbiologiska metoder för undersökning av mykobakteriers DNA blir allt vanligare. I denna studie jämfördes olika PCR-metoder för identifiering av NTM, där metoderna baserades på två tidigare publicerade artiklar. Tester gjordes på DNA från sex NTM-stammar med MTB-DNA som referens. För påvisning av hela släktet Mycobacterium användes primers riktade mot hsp65 och 16S, och för att kunna urskilja MTB från NTM användes primers riktade mot IS6110, IS1081 och ITS-MTC. Undersökningarna visade lägre Ct-värden och högre PCR-effektivitet för hsp65 än för 16S men tester med avseende på MTB-specifika primers visade samtliga amplifiering även för NTM.

Abstract [en]

The most well-known species of the genus Mycobacterium that can cause human disease is Mycobacterium tuberculosis (MTB). Infections caused by other mycobacteria is an increasing problem worldwide. These mycobacteria are known as non-tuberculous mycobacteria (NTM) and they often cause similar symptoms as those in MTB-caused infections. Usually different treatments are required depending on if the infection is caused by NTM or MTB. Current diagnostic methods are based on culture and microscopy, though molecular methods are becoming more common. In this study different PCR-methods for identification of NTM’s were compared. The different methods were based on two earlier published articles. Experiments were made with DNA from six NTM-species and with DNA from MTB as reference. To detect all mycobacteria primers targeting hsp65 and 16S were used, and primers targeting IS6110, IS1081 and ITS-MTC were used to separate MTB from NTM. This study showed lower Ct-values and higher PCR-efficiency for hsp65 than for 16S, but comparative tests regarding MTB-specific primers showed, with all three primer pairs, amplification of NTM as well.

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
Malmö universitet/Hälsa och samhälle , 2020. , s. 17
Nyckelord [sv]
Diagnostik, Icke-tuberkulösa mykobakterier, Mycobacterium tuberculosis, NTM, PCR, Non-tuberculous mycobacteria, Diagnostics
Nationell ämneskategori
Medicin och hälsovetenskap
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:mau:diva-26114Lokalt ID: 31633OAI: oai:DiVA.org:mau-26114DiVA, id: diva2:1487663
Utbildningsprogram
HS Biomedicinsk laboratorievetenskap
Handledare
Examinatorer
Tillgänglig från: 2020-11-03 Skapad: 2020-11-03Bibliografiskt granskad

Open Access i DiVA

fulltext(693 kB)344 nedladdningar
Filinformation
Filnamn FULLTEXT01.pdfFilstorlek 693 kBChecksumma SHA-512
6a9b2d73063dd9c1b5d482823d4e87a3e61569f57c93dbb4a8114d4f3123eddaeb478075b10988f619f0f25fd80161e8916e18d63c5bf66b82c9f01b1d0a43e0
Typ fulltextMimetyp application/pdf

Av organisationen
Fakulteten för hälsa och samhälle (HS)
Medicin och hälsovetenskap

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar
Totalt: 344 nedladdningar
Antalet nedladdningar är summan av nedladdningar för alla fulltexter. Det kan inkludera t.ex tidigare versioner som nu inte längre är tillgängliga.

urn-nbn

Altmetricpoäng

urn-nbn
Totalt: 195 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf